Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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