Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc97Q9DBT3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms