Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrpraQ9DBG7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms