Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc89Q9DA73 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms