Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms