Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp12Q9D9M2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp12Q9D9M2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp12Q9D9M2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp12Q9D9M2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp12Q9D9M2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp12Q9D9M2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp12Q9D9M2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp12Q9D9M2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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