Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tmco5aQ9D9D5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tmco5aQ9D9D5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tmco5aQ9D9D5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmco5aQ9D9D5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmco5aQ9D9D5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmco5aQ9D9D5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tmco5aQ9D9D5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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