Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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