Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl4Q9D8E6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl4Q9D8E6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms