Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Chp2Q9D869 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Chp2Q9D869 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms