Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn22Q9D7U6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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