Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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