Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms