Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms