Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms