Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms