Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms