Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ToporslQ9D2F8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms