Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms