Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms