Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ift27Q9D0P8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ift27Q9D0P8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ift27Q9D0P8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ift27Q9D0P8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ift27Q9D0P8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift27Q9D0P8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ift27Q9D0P8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ift27Q9D0P8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ift27Q9D0P8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ift27Q9D0P8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift27Q9D0P8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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