Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms