Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms