Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms