Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmpcbQ9CXT8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms