Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atxn3Q9CVD2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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Atxn3Q9CVD2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Atxn3Q9CVD2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Atxn3Q9CVD2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Atxn3Q9CVD2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Atxn3Q9CVD2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Atxn3Q9CVD2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Atxn3Q9CVD2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Atxn3Q9CVD2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Atxn3Q9CVD2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atxn3Q9CVD2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Atxn3Q9CVD2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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