Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms