Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms