Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ykt6Q9CQW1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ykt6Q9CQW1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms