Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms