Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms