Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ndufb9Q9CQJ8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms