Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700129C05RikQ9CQ77 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms