Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpa3Q9CQ71 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms