Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms