Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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