Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sike1Q9CPR7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sike1Q9CPR7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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