Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms