Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms