Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup155Q99P88 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms