Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms