Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms