Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp11Q99K46 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp11Q99K46 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp11Q99K46 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp11Q99K46 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp11Q99K46 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp11Q99K46 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp11Q99K46 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp11Q99K46 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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