Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms