Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmd6Q99JI4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms