Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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Slc8b1Q925Q3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Slc8b1Q925Q3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Slc8b1Q925Q3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Slc8b1Q925Q3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Slc8b1Q925Q3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Slc8b1Q925Q3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Slc8b1Q925Q3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Slc8b1Q925Q3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Slc8b1Q925Q3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Slc8b1Q925Q3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms