Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms