Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarca5Q91ZW3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms