Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms