Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usb1Q91W78 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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